六安大學科技園建設領導小組：建設領導小組是推進六安大學科技園建設工作的領導機構，領導小組組長由市長兼任，領導小組下設辦公室，辦公室為領導小組具體辦事機構，辦公室設在市科技局，辦公室主任由市科技局局長兼任。在六安大學科技園建設過程和啟動區運營期間，領導小組及辦公室負責各項工作的組織領導、協調和啟動區管理工作。

    六安大學科技園發展有限公司：公司由市政府和六安集中示范園區工委共同出資2000萬元成立,具體負責六安大學科技園各項運營管理工作。在六安大學科技園建設期間和啟動區運營期間，六安大學科技園工作由六安大學科技園建設領導小組辦公室負責統一組織領導和協調。